На первый взгляд, между популярной Кёко Хори и скромным Идзуми Миямурой нет ничего общего.
Однако Кёко вовсе не так беспечна, как кажется — она вынуждена следить за порядком в доме и присматривать за младшим братом, да и Идзуми совсем не тот, за кого себя выдает — под школьной формой он скрывает татуировки и пирсинг.
Такие разные, но они всё же чем-то похожи, поэтому быстро становятся друзьями.
Прошло два года с тех пор, как команда супербойцов под предводительством Клауда Страйфа спасла мир от кошмарного злодея Сефирота.
Настал мир, и могучий Клауд удалился от дел, поселившись в сиротском приюте, чтобы среди детей забыть о кровавых битвах прошлого.
Но покой ему только снится: жителей планеты начинает поражать странная болезнь, а в окрестностях появляется таинственный незнакомец по имени Кададж, явно замышляющий дурное.
И его недобрые планы как-то связаны с беззащитными сиротами.
В прошлом великий герой Сефирот уничтожил деревню, в которую он пришёл вместе с Заком и Клаудом в поисках матери, после чего направился в горы к реактору Мако, где находится его мать Женова.
Беспокоясь об отце, туда побежала девушка Тифа Локхарт, а потом солдаты Зак и Клауд.