Черепашки-ниндзя

В самом конце Рафаэль произносит фразу «Классно быть черепахой!»(I love being a turtle!). Эту же фразу Микеланджело произносил в первом фильме, и все черепашки (после победы над Супер-Шреддером) во втором фильме.

Как заявил режиссёр мультфильма Кевин Манро в комментариях на DVD, песенка, которую Сплинтер напевает, входя на кухню, это старинная японская колыбельная. Мако исполнил её экспромтом.

В мультфильме героям противостоят 13 чудовищ, некоторые из них мифологического происхождения. Это можно сказать о снежном человеке, который появляется в недостроенном здании, ещё одно является циклопом, голубей на крыше пожирают горгульи, а чудище в кафе очень напоминает легендарного дьявола из Джерси.

В время схватки Ночного Всевидящего с чудовищем в кафе на монстра падает холодильник, музыка обрывается, и зритель слышит, как чудовище издаёт хнычущие звуки. Звуки появились из-за какого-то сбоя в саундтреке, но авторам мультфильма они так понравились, что было решено оставить их в мультфильме.

По большей части облик Сплинтера соответствует тому, что зрители видели в прежних фильмах (где его тело покрыто бурым мехом), однако в этом мультфильме он одет в кимоно, а не в тряпьё, как прежде. Кроме того, в отличие от прежних появлений на экране здесь у Сплинтера целое правое ухо. Кевин Манро как-то пошутил, что Сплинтер сделал себе отопластику (восстановление ушной раковины или недостающих её частей).

В финале Рафаэль произносит фразу «Мы наносим удар и растворяемся в ночи». Этими же словами заканчивается первый комикс о черепашках-ниндзя.

Как сказал режиссёр в комментарии на DVD, в одном из первых вариантов сюжета предполагалось, что Рафаэль погибнет, а Донателло применит технологии Макса Винтерса, чтобы вернуть его к жизни. Вскоре один из авторов сценария Питер Лэрд отверг этот поворот сюжета. Ему не понравилась мысль, что кто-то из главных героев погибнет.

Некоторые реплики в мультфильме взяты из прежних фильмов, где мультипликация чередовалась с игрой актёров. Во время схватки с Кланом Футов Кейси Джонс говорит: "Две минуты за игру высоко поднятой клюшкой!"- фразу, которую он уже произносил. Последней репликой фильма становятся слова Рафаэля "Классно быть черепахой!" Эта же фраза звучит во всех предыдущих фильмах франшизы.

Сюжет будущего фильма «Черепашки-нинзя 2» должен в общих чертах повторять сюжет «Войны в городе», саги комиксов, состоящей из 13 частей. Чувствуя определённое отчуждение, Микеланджело полагает, что его никто не воспринимает всерьёз. Руководствуясь наилучшими побуждениями, он сбегает от братьев и присоединяется к Клану Футов и надевает бандану чёрного цвета. Черепашки-ниндзя в это время отправляются в Японию, где сталкиваются с Карай, а заканчивается всё возвращением их давнего врага Шреддера. В следующем после этого фильме предусмотрено появление трицератонов, и также прибытие из Измерения Х Технодрома, сферической передвижной крепости. Толчком ко всем этим событиям послужат действия Донателло. Кевин Манро хотел, чтобы командующий Технодромом говорил с экрана голосом Майкла Кларка Дункана. Он даже придумал постеры для фильма «Черепашки-ниндзя 2» ("блестящий после дождя асфальт, крышка канализационного люка, а рядом с ним оранжевая бандана Микеланджело") и его продолжения ("Технодром и маленькие фигурки черепах вдалеке").

В первом эпизоде с Ночным Всевидящим, когда преступники уже разбегаются, на одной из вывесок магазинов вдалеке написано «monro» хираганой (это японская слоговая азбука). По всей видимости, имеется в виду режиссёр Манро.

Некоторые поклонники считают, что этот фильм является свободным продолжением оригинальной трилогии, которое не учитывает событий, описанных в телесериале «Черепашки-ниндзя: Новая мутация» (1997-1998), и что действие фильма разворачивается в отдельной вселенной. Это не так. В конце фильма на экране появляются предметы, знакомые зрителю по прежним фильмам — шлем и посох Шреддера, маска члена Клана Футов, канистра мутагена, который изменил облик главных героев и Сплинтера (на ней стоит аббревиатура TCRI, а не TGRI, то есть Techno Global Research Industries, хотя пробоина на боку канистры на букве «C» позволяет разночтения), скипетр времени, шляпа Уокера, шлем повелителя Норинаги, а также части доспехов, которые черепашки-ниндзя носили в третьем фильме франшизы.